Hatalı bir dönüştürme, iki kardeşin bazı uzuvlarını kaybetmesine yol açar. Bunları geri almanın ise bir bedeli vardır. Simyacı Edward Elric, kardeşi Al'ın bedenini eski hâline getirmeye çalışırken askerî hükûmet ve gizemli canavarlar onu yakından takip etmektedir.